Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPB2P35606 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPB2P35606 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms