Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC13P31276 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXC13P31276 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXC13P31276 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXC13P31276 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXC13P31276 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXC13P31276 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXC13P31276 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXC13P31276 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HOXC13P31276 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HOXC13P31276 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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