Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTAFRP25105 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms