Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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PTPRBP23467 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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PTPRBP23467 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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PTPRBP23467 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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PTPRBP23467 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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PTPRBP23467 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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PTPRBP23467 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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