Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

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Length 629 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SMPD1P17405 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SMPD1P17405 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SMPD1P17405 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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