Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms