Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms