Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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ARL2-SNX15V9GYD0 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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ARL2-SNX15V9GYD0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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ARL2-SNX15V9GYD0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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