Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms