Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms