Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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