Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms