Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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