Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CCDC88CQ9P219 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CCDC88CQ9P219 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CCDC88CQ9P219 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CCDC88CQ9P219 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CCDC88CQ9P219 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CCDC88CQ9P219 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CCDC88CQ9P219 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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