Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms