Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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