Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC2Q9BYS8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms