Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms