Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms