Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms