Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE8

TTC16, Tetratricopeptide repeat protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC16Q8NEE8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms