Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms