Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms