Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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LRRC28Q86X40 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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LRRC28Q86X40 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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LRRC28Q86X40 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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LRRC28Q86X40 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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LRRC28Q86X40 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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LRRC28Q86X40 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LRRC28Q86X40 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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