Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms