Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUFY3Q7L099 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms