Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms