Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms