Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms