Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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