Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SP6Q3SY56 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms