Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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