Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PFKFB3Q16875 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms