Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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