Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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