Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TUSC5-201ENST00000333813 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CCNA1-201ENST00000255465 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 EGFR-211ENST00000638463 4735 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 KCTD7-209ENST00000640385 4118 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ANXA11-205ENST00000438331 6965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PMEPA1-203ENST00000347215 4546 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PMEPA1-205ENST00000395816 4519 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ZC3H13-202ENST00000282007 6412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PTGIS-201ENST00000244043 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TADA2B-205ENST00000515646 3818 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SPCS1-206ENST00000619898 4254 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PASK-215ENST00000544142 4724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 GAS7-201ENST00000323816 8033 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 GAS7-204ENST00000437099 8003 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 FAM131A-211ENST00000639617 4450 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 LAMA4-201ENST00000230538 6547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 DAPK2-213ENST00000612884 8086 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 FGF11-202ENST00000572907 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CEP41-201ENST00000223208 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CARMN-210ENST00000602964 8398 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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