Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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