Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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