Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms