Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CDH18Q13634 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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CDH18Q13634 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CDH18Q13634 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CDH18Q13634 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CDH18Q13634 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CDH18Q13634 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CDH18Q13634 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CDH18Q13634 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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