Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms