Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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