Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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