Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms