Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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