Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 281.7 ms