Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms