Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms