Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP46P62068 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms