Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PLEKHA6-205ENST00000637508 5704 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 OLFML2A-201ENST00000288815 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PKP1-201ENST00000263946 5447 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SPATA6-203ENST00000371847 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms